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Research Lab ​

这趟旅程里唯一产出真东西的地方。

前面几层是输入:概念、论文、工具。这一层是输出——设计、跑、失败、改。

Projects ​

🧬 Thermal protein Switch ​

Status🔵 Planned
Goal一个 42℃ 打开的 protein 开关
Started—
d
Design goal. 常温下自抑制,升到 42℃ 构象打开,恢复 蛋白质 活性。

Success criteria.(开工前就定死,不许事后改)

  • 37℃ 与 42℃ 之间活性差 ≥ 10 倍
  • 42℃ 下活性 ≥ 野生型的 20%
  • 可逆

Workflow.

Idea → RFdiffusion → ProteinMPNN → AF3 → Rosetta → 筛选 → 表达纯化 → 活性测定

Open questions.

  • 热开关用 coiled-coil 解链,还是用一个 metastable 的 lid?
  • 42℃ 这个点怎么调?Tm 是设计出来的还是筛出来的?
  • 阴性对照该怎么设计——一个"永远关着"的版本?

更多项目 ​

做出来一个再写一个。这里空着不丢人,写满了假项目才丢人。

Project Log ​

公开的、按时间倒序的流水账。失败也写——尤其失败要写。

  • 2026-07-16启程。v1.0 框架上线:Dashboard、Knowledge Map、Curriculum、模板、导航。还没有任何知识内容——先把路修出来,再上路。

实验记录 ​

每个实验用 Experiment 模板。

关键规矩:Hypothesis 和 Success criteria 必须在跑之前写。

写在之后的叫故事,不叫科研。

chuanbaozheng77@gmail.com