蛋白质设计
蛋白质的功能由结构决定,而结构可以被设计。我关注如何用 Rosetta、AlphaFold 这类工具, 把一个模糊的功能需求,一步步收敛成可折叠、可表达的氨基酸序列。这个过程里,计算预测只是起点—— 每一个设计最终都要回到湿实验台上,接受表达、纯化与表征的检验。我更感兴趣的是这两端之间的落差: 模型说会折叠的蛋白,为什么在瓶子里不听话;反过来,那些"意外"成功的结果,又能不能反哺下一轮设计。 → 蛋白质设计笔记
Chuanbao Zheng · 研究方向
这里记录我在蛋白质设计与湿实验之间摸索的过程 —— 从一次失败的克隆,到一次成功的折叠预测。 关于我 · 研究日志 · 联系我
蛋白质的功能由结构决定,而结构可以被设计。我关注如何用 Rosetta、AlphaFold 这类工具, 把一个模糊的功能需求,一步步收敛成可折叠、可表达的氨基酸序列。这个过程里,计算预测只是起点—— 每一个设计最终都要回到湿实验台上,接受表达、纯化与表征的检验。我更感兴趣的是这两端之间的落差: 模型说会折叠的蛋白,为什么在瓶子里不听话;反过来,那些"意外"成功的结果,又能不能反哺下一轮设计。 → 蛋白质设计笔记
再好的设计也要靠双手兑现。分子克隆、蛋白表达、纯化与表征,是把序列变成可验证事实的必经之路。 我把每一次踩过的坑、每一版跑通的流程都记下来——不是为了炫耀成功,而是为了下一次少走弯路。 这部分笔记更像一本操作手册,写给未来某个凌晨两点还在实验室、需要一个答案的自己。 → 实验技能笔记
技术之外,我也在读书里找方法论。把读过的书拆解、消化,沉淀成能指导下一步决策的东西, 而不只是书架上又多了一行记录。这部分笔记记录的是思考方式的迭代,和技术笔记互为补充。 → 读书笔记